Должен сказать, что процесс регистрации ПО несложный, так как требований к софту почти никаких, предоставляете листинг программы с описанием и все. Уверен, что так можно зарегистрировать даже результаты выполнения лабораторной работы студента-первокурсника по программированию, вопрос лишь в том, под каким соусом это преподнести. :) Однако поработать и побегать с бумажками все же придется. Отмечу ключевые пункты на примере КНИТУ-КАИ с коллективной разработкой:
- подготовка материалов,
- передача и утверждение документов в патентном отделе,
- сбор подписей, при этом в ходе утверждения формы коммерциализации с Вас могут потребовать участие в конкурсе типа "50 инновационных идей", на что крайне рекомендую любезно ответить "Да". :)
- передача подписанных документов в патентный отдел.

Не забывайте, что поступив таким образом, правообладателем будет являться КНИТУ-КАИ. Хотя для успешной защиты диссертации это не так критично, ведь авторство все равно за Вами. Успехов!

P.S.: Наградой за труды будет свидетельство.

https://bitbucket.org/landwatersun/forum/downloads/201711231150.jpg